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activemotif 常見問(wèn)題問(wèn)答
發(fā)布時(shí)間： 2022-12-20 點(diǎn)擊次數(shù)： 977次activemotif 常見問(wèn)題問(wèn)答
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ATAC-Seq Kit常見問(wèn)題
1、此試劑是否和Buenrostro et al在nature上發(fā)表的方法一樣？
Active motif 基于最初Buenrostro 的文章和2017年Corces et al. 在nature上發(fā)表的文章，優(yōu)化了緩沖液以滿足跟多的實(shí)驗(yàn)需求和高效的實(shí)驗(yàn)過(guò)程。
2、試劑盒中包含的重組Tn5酶的來(lái)源是？
此試劑盒中的Tn5是由我司克隆，表達(dá)，純化，驗(yàn)證的超活性突變克隆。所提供的這款轉(zhuǎn)座酶預(yù)先已鏈接好用于NGS測(cè)序的接頭（adaptor）序列，所以它不許任何預(yù)處理過(guò)程，可直接用于實(shí)驗(yàn)。
3、每個(gè)反應(yīng)需要使用的小的細(xì)胞數(shù)量或者組織量是多少？
50,000個(gè)細(xì)胞或20 mg組織樣本。
4、可以使用凍存的組織和細(xì)胞嗎？
可以，但樣本得保證高質(zhì)量且高活性，細(xì)胞應(yīng)在控制速率冷凍中冷凍保存（例如細(xì)胞凍存液梯度凍存），冷凍介質(zhì)的配方應(yīng)防止冰晶形成和隨后的細(xì)胞損傷，組織應(yīng)在-80°C下快速冷凍。
5、可將細(xì)胞核凍存后用于后續(xù)ATAC-seq實(shí)驗(yàn)嗎？
可以的，提取的細(xì)胞核可以-80℃凍存用于后續(xù)使用。制備的同樣品細(xì)胞核可合并在一起增加樣本量。
6、可以使用FACS分選后的細(xì)胞嗎？
可能可以。但FACS后細(xì)胞可能會(huì)被破壞。一個(gè)高質(zhì)量的ATAC-seq 文庫(kù)需要高質(zhì)量高活性的細(xì)胞。
7、您是否建議使用40微米篩孔的細(xì)胞樣本過(guò)濾器？
是的，我們推薦使用Falcon 40微米過(guò)濾器（Falcon貨號(hào)：352340）。
8、所有樣本都需要DNase處理嗎？
DNase的處理能夠幫助確定懸液中游離DNA的去除，如線粒體DNA的去除，如果細(xì)胞樣本中有15%的死亡率，細(xì)胞活性不夠且必須使用此酶，它最終可能會(huì)移除你想要的細(xì)胞數(shù)據(jù)。只有當(dāng)細(xì)胞是活較高時(shí)，并且不會(huì)被酶消化時(shí)，才建議將其作為一種選擇。
9、若沒有thermomixer，是否還能使用此試劑盒？
建議使用Thermomixer。然而，我們已經(jīng)對(duì)此進(jìn)行了測(cè)試，在37°C溫度下不使用thermomixer而是在帶熱蓋的熱循環(huán)器中進(jìn)行轉(zhuǎn)座反應(yīng)，反應(yīng)能夠成功。
10、 是否能夠室溫融化此試劑盒包含的所有試劑盒組分，如master mixes和酶？
除了轉(zhuǎn)座酶和Q5 DNA polymerase 以外，其他試劑均可室溫融凍。轉(zhuǎn)座酶和Q5 DNA polymerase 包裝中含有甘油，不會(huì)被凍結(jié)，請(qǐng)直接放在冰上使用。其他組分可融凍多次用于以后使用，所以不需要一次性將16次的試劑用完。
11、 每個(gè)樣本需要測(cè)序多少量的reads？
常規(guī)20 M reads的測(cè)序量就足夠了。
北京華新康信也有Activemotif實(shí)驗(yàn)試劑銷售，下面給大家講講Activemotif服務(wù)以及實(shí)驗(yàn)樣本；Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio Toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin Activemotif實(shí)驗(yàn) Activemotif試劑 Activemotif說(shuō)明 Activemotif試劑方案Activemotif實(shí)驗(yàn)說(shuō)明 Activemotif說(shuō)明書 Activemotif技術(shù)參數(shù) Activemotif方案對(duì)比 Activemotif介紹 Activemotif廣州試劑 Activemotif深圳試劑Activemotif說(shuō)明書 Activemotif技術(shù)參數(shù)Activemotif實(shí)驗(yàn)方案Activemotif技術(shù)對(duì)比Activemotif購(gòu)買說(shuō)明 Activemotif江蘇試劑 Activemotif北京試劑Activemotif廈門試劑Activemotif大理試劑Activemotif武漢試劑Activemotif福建試劑Activemotif安徽試劑Activemotif廣西試劑Activemotif廈門試劑Activemotif常州試劑Activemotif安徽試劑Activemotif長(zhǎng)沙試劑Activemotif哈爾濱試劑Activemotif沈陽(yáng)試劑Activemotif深圳試劑Activemotif武昌試劑Activemotif湖北試劑Activemotif湖南試劑Activemotif上海試劑Activemotif ForteBio實(shí)驗(yàn)試劑，moltox實(shí)驗(yàn)試劑，toxin實(shí)驗(yàn)試劑，ForteBio moltox toxin 各種試劑的實(shí)驗(yàn)參數(shù)，說(shuō)明書，歡迎咨詢 Activemotif試劑介紹 Activemotif試劑介紹 Activemotif研究方案
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其他的這些是菌株
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